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当个体健康状况不佳时，使用睾酮替代疗法存在一些问题。一项研究分析了荷尔蒙替代疗法在流动性有限的65岁及以上人群中的安全性，观察他们的各种健康状况，如肥胖、高血压、糖尿病或高血脂。每个主题每天采取了透皮睾酮凝胶（10g／100mg）或安慰剂，历时六个月。在治疗过程中，共有23个人患有心血管相关的不良症状。而安慰剂组这一数据仅为9个。在另一组对性腺功能减退的中年男性的研究中发现，睾酮替代疗法（庚酸睾酮250mg／2周）是降低血管反应和动脉粥样硬化的重要因素。这些研究表明，患有心脏病或其他慢性疾病的男性应谨慎应用荷尔蒙替代疗法。
对于比较老的患者还有其他的担忧。首先，睾丸酮治疗可能增加前列腺体积和PSA值。虽然这对于正常患者似乎没有临床意义，但良性前列腺增生和前列腺癌可以刺激睾酮。男性患有前列腺癌，高PSA值或乳腺癌一般不能使用睾酮。雄激素补充治疗与睡眠呼吸暂停有关，它会打扰宁静的睡眠。研究已产生了相互矛盾的数据，然而潜在的关系仍然是许多争论的主题。毕竟睾酮替代疗法对老年男性表现出了积极，中立还有消极这几种不同的作用。研究表明，剂量可以控制反应的水平，当雄激素水平达到正常范围上限时，会产生没有超越生理现象的最积极的影响。有认知功能缺陷的老年患者在激素替代治疗中应密切注意其认知功能和血激素水平。
常见的治疗方案：
透皮：在美国和加拿大，透皮应用是最常用的补充睾酮的方法，通常是雄激素替代治疗的第一个疗程。与注射相比，这种药物的输送方式给患者提供了许多好处。由于透皮应用是无痛的，所以增加了病人的依从性和舒适性。透皮应用也提供了稳定的日常性激素水平，且不会出现像注射睾酮甾酮酯时产生的波动。医生使用激素替代疗法的规格大约是每天2.5-10毫克睾酮（近似吸收剂量）。这是作为一个每日更换的擦凝胶或皮贴剂。值得注意的是，由于皮肤的新陈代谢，睾酮透皮应用增加血清双氢睾酮（DHT）的效果比睾酮注射法更好。这可能会加剧一些患者治疗期间的雄激素副作用，导致一些人会寻求睾酮注射法作为一种替代形式。
注射：在美国和加拿大，庚酸睾酮、丙酸睾丸素是最广泛的处方注射睾酮药物。混合酯产品在CTS sustanon 100和sustanon 250等其他市场也被广泛使用。注射这些睾酮酯产品之一会给患者提供约2至3周的雄激素水平。
激素替代疗法的医生中最常见的协议管理200毫克庚酸睾酮环戊丙酸或每2到3个星期一次。重要的是要记住在身体的每个系统中，睾酮酯每天会提供不同程度的睾酮。注射后第一天水平是最高的，然后在接下来的几周内将慢慢下降到基线。医生通常都是鼓励病人密切监测以确保雄激素的补充维持在正常水平范围（缓解症状的性腺功能减退）在整个治疗期间。长效可注射睾酮制剂耐必多（十一碳酸睾酮）正在美国进行审查，并已在其他市场被批准。对于大多数患者来说，这种药物每年只需要注射4到5次。
口服：睾酮（安特尔）是唯一通过口服胶囊提供睾酮的处方药。这种药物在美国是不被批准销售的，但是在加拿大和世界各地的市场都当做处方药出售。这种形式的治疗令病人的依从性和舒适度都提高，因为除了每天吃几粒胶囊外没有其他特殊的要求，。每天口服睾酮的初始剂量通常在1201到160毫克，相当于三到四粒40毫克胶囊。在随后的几个星期每天就可以减到120毫克。该胶囊每天分两次服用，通常是在早餐和晚餐的时候。虽然这种形式的治疗是非常方便的，但是血清激素水平在日常的基础上会有很大的波动。脂肪的消耗量对激素的生物利用度有特别强烈的影响，在最大限度服用胶囊时，建议再额外给身体提供含有20克脂肪的膳食。得注意的是，口服睾酮比注射睾酮更能增加血清双氢睾酮（DHT）的水平。
遗传性血管水肿
遗传性血管水肿一种罕见的潜在威胁生命的疾病，而合成代谢类固醇是用于治疗遗传性血管水肿的常用处方。遗传性血管性水肿是由于凝血因子的基因突变引起的，其特征是蛋白C1酯酶抑制剂水平或功能的降低。这种蛋白质控制着C1，是一种“补体系统”蛋白，在炎症控制中起重要作用。遗传性血管水肿的症状包括间歇性迅速肿胀的手，胳膊，腿，眼睛，嘴唇，舌头，或喉咙。肿胀也可能发生在消化道，并导致腹部绞痛、恶心或呕吐。在最严重的情况下，病人可能会发现咽喉肿胀，呼吸道阻塞，导致窒息和猝死。尽管压力、创伤、手术通常与血管性水肿病相关，但病变的发生没有一个特定的预兆。
口服C-17α-烷基化同化/雄激素类固醇已被证明是预防性治疗的一种形式，能够稳定补体系统蛋白质水平的频率和减少血管水肿的发作.通常是小剂量给药，但对这种疾病长期有效。在美国最常用的合成代谢类固醇是康力龙和达那唑，虽然历史上许多其他的药物也被用过，例如氧雄龙、甲基睾丸酮、羟甲雄酮，甲睾酮，和去氢甲睾酮。所需的类固醇的量可以根据个体的不同而有所不同，并通常保持在最低的治疗有效剂量，以抵消不良的副作用。FDA批准的初始剂量为每次2毫克每日三次（每天6毫克），然后慢慢的向下调整到每1至2天一次达到稳定水平。
贫血
作为一类药物，同化/雄激素类固醇会刺激促红细胞生成素在肾脏的合成，一种能生成新的红血细胞的激素。通过这个，类固醇激素增加红细胞数和红细胞压积，使其具有治疗某些贫血的有形治疗价值（以红细胞缺乏为特征的疾病）。下面是激素可以治疗的一些贫血形式，有肾功能不全贫血、镰状细胞性贫血，难治性贫血、再生障碍性贫血，骨质纤维化，骨髓硬化症，病因不明的髓样化生和恶性肿瘤或骨髓毒性药物引起的贫血。反应水平取决于患者、治疗类型和贫血类型，但在许多情况下，可以实现正常的血细胞比容水平的稳定。
在美国，无论是羟甲雄酮（Anadrol 50）和癸酸诺龙（德卡Durabolin）都被FDA批准用于治疗重症贫血。用羟甲雄酮治疗男性和女性贫血患者（儿童和成人）的推荐剂量为1-2毫克/公斤/天。这相当于一个体重约160磅的人每日需要75-150毫克的剂量。为了达到所需的治疗反应，高达5毫克/公斤/天有时也是必要的。癸酸诺龙指南推荐剂量为妇女每周50-100毫克男人每周100-200毫克。儿童（2岁至13岁）推荐剂量为每3到4周25-50毫克。
近年来，重组促红细胞生成素作为处方药的问世，大大改变了贫血治疗的面貌。而同化/雄激素类固醇仍然能提供治疗的价值，并被销售以治疗贫血患者。当单独使用促红细胞生成素没有实现期望的效果时，他们就会被视为辅助或备用药物。同化/雄激素类固醇的使用令红细胞压积增加通常比新的促红细胞生成素更不可预测和积极，适量的这些药物用来刺激红细胞生成也会产生很明显的副作用，，尤其是对于妇女和儿童。在许多情况下，风险大于同化/雄激素类固醇治疗的好处，因为有新的和直接的靶向药物具有低副作用的潜力。
乳腺癌
同化/雄激素类固醇经常被用于治疗切除卵巢的绝经后或绝经前女性的乳腺癌。这些药物在癌症是激素反应的时候很有价值，这意味着它的生长受到激素操纵影响（正或负）。雄激素和雌激素对激素应答的肿瘤有相反的作用，雌激素支持乳腺癌组织的增长而雄激素抑制它的生长。同化/雄激素类固醇的补充可以使雄激素转移到雌激素的平衡方向。这有助于减少肿瘤的大小，这是一种在相当数量的患者中取得成功反应的治疗方法。类固醇激素治疗的男性化副作用在女性中非常明显，因此疗法一开始通常是非常谨慎的。口服雄激素首选的通常是甲睾酮，而慢注射类固醇激素通常选苯丙酸诺龙等，但如果出现很明显的不受欢迎的副作用，它们就可能突然被停止使用。但是作为两个主要的合成代谢剂已被广泛用于此目的。
近年来，新的更有针对性的抗雌激素药物如选择性雌激素受体调节剂（SERMs）的发展和芳香化酶抑制药物几乎完全淘汰了用同化/雄激素类固醇来治疗乳腺癌的方法。乳腺癌药物治疗通常使用选择性雌激素受体调节剂他莫昔芬（三苯氧胺）等，或者一种强大的芳香化酶抑制剂如瑞宁得（阿那曲唑）或Femara（依西美坦）。同化/雄激素类固醇仍在美国和其他许多国家用于治疗乳腺癌。当单独使用抗雌激素药物治疗未能达到预期的反应时，他们才会被视为辅助或备用药物。
纤溶活性降低
合成代谢类固醇可用于治疗纤溶活性降低相关的疾病。纤溶是指血液凝块被机体分解或代谢的过程。它代表的是与血液凝固的对抗，这两个系统相互对抗，以维持止血平衡。纤溶系统的疾病是罕见的，虽然它们出现时是特别的严重。纤溶活性降低可导致凝血因子的改变，大大增强了凝固（高凝状态），增加了严重心血管疾病的风险，如心脏病发作，中风或血栓。口服C17α-烷基化合成代谢类固醇可提高纤溶活性，因此对于许多凝血酶III缺乏或纤维蛋白原而导致的纤溶活性降低的患者来说是特别有好处的。虽然类似的治疗效果可以从使用许多其他合成代谢类固醇得到，但在美国最常用的是司坦唑醇。使用剂量是依个人而定的，并通过密切监测对凝血参数的副作用和变化而确定。酯化注射和口服非甾体酯烷基化不产生相同的纤溶反应。
不育（男性）
在少数情况下，同化/雄激素类固醇可用于治疗男性不育症。当不育的原因是由于睾丸间质细胞秘密低精子浓度离子不时足，雄激素可能能缓解病情。在这种情况下，类固醇可能会增加精子计数，精子质量和果糖浓度，可以增加受孕机率。口服雄激素美睾酮是最常用的用于此目的的药物，尽管还没有在美国获得FDA批准销售。注意，同化/雄激素类固醇通常会降低男性的生育能力，所以这些药物成功治疗男性生育的潜力有限。
生长障碍
合成代谢类固醇可用于治疗儿童生长发育不良，不管有或者没有生长激素的缺乏。这些药物已被证明对肌肉和骨骼有积极的影响。当长骨末端（骨骺）融合并停止进一步的线性生长时，它们可以使其具有继续生长的可能性。这既可以通过类固醇对骨细胞的直接合成作用，也可以通过生长激素和IGF-1释放的刺激而间接发生。非aromatizable和非雌激素的类固醇通常用于此目的，因为雌激素会加快生长的停滞。在儿科患者中，使用合成类固醇治疗必须谨慎因为除了常见的不利影响外，非aromatizable类固醇还会加速骨骺的闭合率。
在美国，氧甲氢龙是最广泛用于治疗生长衰竭类固醇。它通常是作为一种支持性药物，用于增加人类生长激素的治疗。该药物通常一次服用6-12个月，以加速生长率而不影响骨骺融合率。用于此目的的剂量一般为每天2.5毫克，根据患者的性别、年龄、体重和不良影响的敏感性可向上或向下调整。在最佳条件下使用与不使用相比，极有可能会有一个很高的增长率和总高度的增加。这种效益在临床研究中很难实现。大量氧雄龙的试验没有对总高度产生显著影响，所以其价值现在遭受到质疑。但合成代谢类固醇短期内对生长速度的提升使其仍然得到很好的支持。
性欲（女）
甲基睾酮是受批准的销售在美国和许多其他市场的处方药，旨在提高更年期女性患者的性欲。药物里通常还含有小剂量的雌激素，目的是为了治疗更年期症状的全频谱，如被减弱的女性性欲。与其他临床应用的甲睾酮相比，使用的剂量很低，通常不会超过2mg每天。
然而在美国，使用合成类固醇激素，如苯丙酸诺龙对骨质疏松症的治疗目前被认为是有争议的。尽管在美国有大量的临床数据和历史支持这种疗法，但许多医学组织仍然认为类固醇治疗的潜在副作用太大，无法证明其对骨质疏松症的益处。目前FDA没有批准其用于此目的。氧雄龙仍然是FDA批准用于骨质疏松症患者的药物，但只是缓解了与该疾病有关的一些骨疼痛，并不是增加骨密度。然而，在许多其他国家，合成类固醇仍然被用于治疗骨质疏松症，并且仍被规定为不同的患者人群治疗，包括了男性、女性和老年人。
骨质疏松症
合成类固醇能增加骨密度，可用于治疗骨质疏松症。用其治疗的好处包括刺激新骨的形成，抑制骨吸收（击穿），并提高钙吸收。这些药物还可以减少老年患者的骨疼痛，以及一些频繁的并发症。骨质疏松症在绝经后妇女中是最常见的，通常与荷尔蒙的变化有关，着在以后的生活中会被注意到。这种激素紊乱在中老年人中高度发生。长期使用皮质激素也会导致骨质疏松，从而直接刺激骨吸收，抑制新骨的生长。这被确定为类固醇或糖皮质激素引起的骨质疏松症。
癸酸诺龙是最常用的用于治疗骨质疏松症的合成代谢类固醇。药物对于骨密度能够提供可衡量的好处，并可减少患者骨折的可能性。用于治疗绝经后妇女的剂量通常是每3到4周50毫克。但治疗也很经常出现副作用，男性化症状（声音嘶哑、身体/面部毛发生长）和血清胆固醇的不良变化。65岁以上的患者对于这种治疗有更好的耐受性，因为这个群体出现比较少的副作用。男性患者的苯丙酸诺龙剂量为50毫克每1到2周。治疗男女双方通常都要进行至少六个月，如有必要得持续一年或更长时间。长期的治疗时间通常是为了使药物显著的影响到骨强度。
特纳和克氏综合征
同化/雄激素类固醇可用于治疗某些遗传性疾病，在女性中最常见的特纳氏综合征而男性则是克氏综合征。都是染色体异常或偏离正常的XY / XY配对。他们导致（在其他健康问题）生长，性发育和持续性功能异常。患有克氏综合征的男性是不育的，通常有一个胖（很少肌肉）的体质。他们还可能发育成小睾丸（小睾丸症），并可能患有男性乳房发育症。在这些患者中补充睾酮（以类似的方式，使用激素替代疗法）是常见的，可以帮助缓解一些性功能和身体成分的问题。女性的特纳综合症将导致她们身材矮小，并有其他的身体异常之处，包括宽阔的胸部，低发际线，低耳朵还有蹼颈。低剂量的主要合成代谢类固醇可用于青少年患者作为辅助生长激素治疗，来帮助身体的线性增长。氧雄龙在美国是最常用于这一目的的类固醇，每天每千克的人0.5-1毫克已在临床上成功地增加了患者最终的身高。
体重减轻/肌肉流失
合成类固醇临床上可用于治疗体重的显著减轻 。常见的原因包括长期皮质类固醇治疗，频繁的手术，慢性感染或严重创伤。一般来说，这些药物在病人需长期住院或卧床休息期间，还有正常的肌肉刺激不存在或肌肉损失时特别有用。严重烧伤也可能用合成代谢类固醇来治疗，因为这是一种与继发性肌肉损伤相关的损伤类型。合成代谢类固醇还可以用来治疗与任何已知的病因不相关的体重下降。未能保持健康（正常）的体重水平，通过大量食物和运动改善体重下降，通常推荐这种治疗。
体重的重大损失会引发一系列健康问题。长期体重不足的人常常会会有无力感，并有很大的死亡风险。在手术或者疾病恢复期间体重下降会明显延缓恢复时间。在极度的情况下，病人维持能否维持最低体重是疾病痊愈的关键。
合成类固醇增加蛋白质合成的能力，使他们成为为临床上治疗体重降低最被接受的药物。当病人没有医疗条件或没有采取其他任何药物，将提供他们使用这些药物。可以积极影响肌肉和骨骼使它们成为了非常多才多艺的合成剂。
在美国，氧甲氢龙是最常见的用于治疗各种临床上经典的体重降低的处方药。用于此目的的剂量通常为10毫克每次，然后每天两次（共20毫克）。为了避免不良的雄激素副作用，某些女性，老人还有较年轻的患者可能会降低剂量。这种药通常服用的时期是在恢复的早期阶段的3至4周，必要时可能会用更长的时间。能够帮助蛋白质的构建几乎是所有的类固醇药物共有的特质。氧甲氢龙外的很多药物在临床上对此都是很有用的。在其他许多领域里，还有很多用于此目的的合成代谢雄性激素，包括康力龙、诺龙、美替诺龙，以及美雄酮等。
合成类固醇也可用于治疗更严重的肌肉萎缩。这是一种以持续的蛋白质分解代谢为特征的状态，这意味着肌肉蛋白在体内正在被分解（而不是合成），并逐渐丧失重量、强度和能量。在医疗上，严重的肌肉萎缩被称为恶病质。恶病质与食物摄入不足（饮食营养不良）无关，但其代谢原因与饮食变化不能缓解有关。这个原因通常也被确定在讨论条件下（即癌症恶病质，HIV相关恶病质）。HIV相关的肌肉萎缩是最常见的用同化激素治疗的恶病质。使用这些药物作为治疗癌症恶病质的辅助疗法尚未建立，但是，目前正在进行研究。
癸酸诺龙，氧甲氢龙，和羟甲雄酮是美国最常用的治疗与HIV感染相关肌肉萎缩的类固醇。虽然没有被 FDA所采纳，但癸酸诺龙的研究表明，每14天150毫克的剂量与每天6毫克的生长激素有一个类似的同化效益，并且出现副作用的概率显著降低。羟甲雄酮是消耗HIV 研究中第III期临床试验的主要激素。研究出来100-150毫克/天的剂量和那些医生开具的剂量相差无几。然而，近年来癸酸诺龙在医药市场的中止，使能让病人感到更舒适的氧甲氢龙成为治疗HIV恶病质的首选药物。氧甲氢龙的使用范围每天可以从20毫克到80毫克。已经被发现的最佳的临床效益是每日40毫克和80毫克。
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